PCR概念
聚合酶鏈反應(yīng)(基因擴(kuò)增):基本原理 類似于DNA的天然復(fù)制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補(bǔ)的寡核苷酸引物。PCR是模擬體內(nèi)DNA復(fù)制過程,在體外特異性擴(kuò)增DNA片段的一種技術(shù)。
PCR的應(yīng)用領(lǐng)域
1、遺傳病和某些疑難病的診斷
2、病原體的檢測。某些惡性疾病一般用微生物學(xué)、生化和免疫 學(xué)技術(shù)無法查出病原體時,可用PCR來檢查。
3、法醫(yī)和刑偵鑒定。
4、癌基因的檢查。
5、基因探針的制備。
6、基因組測序、染色體巡視。
7、cDNA庫的構(gòu)建。
8、基因突變的分析和定位誘變。
9、DNA重組。
10、基因的分享和克隆。
標(biāo)準(zhǔn)的PCR過程分為三步
DNA變性
(90℃-96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下,氫鍵斷裂,形成單鏈DNA
退火
(60℃-65℃):系統(tǒng)溫度降低,引物與DNA模板結(jié)合,形成局部雙鏈。
延伸
(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性最佳)的作用下,以dNTP為原料,從引物的3′端開始以從5′→3′端的方向延伸,合成與模板互補(bǔ)的DNA鏈。
PCR儀的分類
根據(jù)DNA擴(kuò)增的目的和檢測的標(biāo)準(zhǔn)可以將PCR儀分為普通PCR儀,梯度PCR儀,原位PCR,實(shí)時熒光定量PCR儀等幾類。
普通PCR儀
一般把一次PCR擴(kuò)增只能運(yùn)行一個特定退火溫度的PCR儀,稱之為普通PCR儀。如果要用它做不同的退火溫度則需要多次運(yùn)行。主要是用作簡單的,對目的基因退火溫度的擴(kuò)增。
梯度PCR儀
一次性PCR擴(kuò)增可以設(shè)置一系列不同的退火溫度條件(通常12種溫度梯度)的稱之為梯度PCR儀。因為被擴(kuò)增的不同的DNA片段其最適合的退火溫度不同,通過設(shè)置一系列的梯度退火溫度進(jìn)行擴(kuò)增,從而一次性PCR擴(kuò)增就可以篩選出表達(dá)量高的最適合退火溫度進(jìn)行有效的擴(kuò)增。主要用于研究未知DNA退火溫度的擴(kuò)增,這樣既節(jié)約時間,也節(jié)約經(jīng)費(fèi)。在不設(shè)置梯度的情況下亦可當(dāng)做普通的PCR用。
原位PCR儀
是用于從細(xì)胞內(nèi)靶DNA的定位分析的細(xì)胞內(nèi)基因擴(kuò)增儀。如病原基因在細(xì)胞的位置或目的基因在細(xì)胞內(nèi)的作用位置等。可保持細(xì)胞或組織的完整性,使PCR反應(yīng)體系滲透到組織和細(xì)胞中,在細(xì)胞的靶DNA所在的位置進(jìn)行基因擴(kuò)增。不但可以檢測到靶DNA,還能標(biāo)出靶序列在細(xì)胞內(nèi)的位置。于分子和細(xì)胞水平上研究疾病的發(fā)病機(jī)理和臨床過程及病理的轉(zhuǎn)變有著重大的實(shí)用價值。
實(shí)時熒光定量PCR儀
在普通PCR儀基礎(chǔ)上增加一個熒光信號采集系統(tǒng)和計算機(jī)分析處理系統(tǒng),就成了熒光定量PCR。其PCR擴(kuò)增原理和普通PCR擴(kuò)增原理相同,只是在PCR擴(kuò)增時加入的引物是利用同位素、熒光素等進(jìn)行標(biāo)記,使用引物和熒光探針同時與模板特異性結(jié)合擴(kuò)增。擴(kuò)增的結(jié)果通過熒光信號采集系統(tǒng)實(shí)時采集信號連接輸送到計算機(jī)分析處理系統(tǒng),得出量化的實(shí)時結(jié)果輸出。
熒光定量PCR儀有單通道,雙通道和多通道之分。當(dāng)只用一種熒光探針標(biāo)記的時候,選用單通道;有多種熒光標(biāo)記的時候使用多通道。單通道也可以檢測多熒光的標(biāo)記和目的基因表達(dá)產(chǎn)物,因為一次只能檢測一種目的基因的擴(kuò)增量,需多次擴(kuò)增才能檢測完不同的目的基因片段的量。
PCR的各個品牌
國產(chǎn)品牌
上海領(lǐng)成、西安天隆、杭州郎基、珠海黑馬、杭州博日、上海宏石、廈門安普利、杭州晶格、北京亞力恩、北京東勝、上海楓嶺。
目前國內(nèi)市場主要被:上海領(lǐng)成,西安天隆,杭州郞基,珠海黑馬,杭州博日五大品牌所占有。
普通PCR儀價格在18000-20000元左右,梯度PCR儀價格在26000-28000元左右,實(shí)時熒光定量PCR儀價格在130000-150000元左右。
進(jìn)口品牌
美國ABI、美國Labnet萊伯特、美國Bio-rad伯樂、英國Genetech、英國Techne、德國Eppendorf艾本德、新加坡Esco藝思高、日本TaKaRa、日本ASTEC、澳大利亞Corbett柯柏特、德國Jena耶拿、德國biometra、德國BOECO、英國CLEAVER科麗沃、瑞士ROCHE羅氏、英國Quanta、德國PEQLAB、荷蘭Creacon、美國Cepheid、美國Thermo熱電。
目前進(jìn)口品牌中美國ABI,美國labnet,美國Bio-rad,日本TaKaRa,英國Techne,德國Eppendorf六大品牌占有率比較高。
根據(jù)近年來銷量分析,其中美國ABI除了9700型普通PCR基因擴(kuò)增儀和2720型基因擴(kuò)增儀外,新推出的高精確性的Veriti梯度PCR儀,也是所有進(jìn)口品牌梯度PCR儀中最受客戶認(rèn)可的一款,是近兩年來銷量較高一款PCR儀;
其次是美國Bio-rad;
日本TaKaRa和美國Labnet梯度PCR儀,價格相對進(jìn)口品牌中比較便宜,質(zhì)量和性能也比較穩(wěn)定,從而深廣大客戶的認(rèn)可,他們的銷售成交價在45000-50000左右,而其它同性能價格的儀器價格在,60000-80000元,所以近年來市場的占有率呈上升的趨勢;
德國Eppendorf和美國Bio-rad是以直銷的模式銷售,因其壟斷直銷方式,外面的經(jīng)銷商或者當(dāng)?shù)氐慕?jīng)銷商無法進(jìn)去競爭,所以相同性能的產(chǎn)品價格相對其他品牌要高很多,成交價格一般在7-9萬元左右,市場占有率相對有所下降;
英國Techne在國內(nèi)生產(chǎn),價格相對進(jìn)口品牌中要低很多,銷量有所上升,市場占有率也上升,價格在35000-40000元左右。